Águila real (Aquila chrysaetos)
El programa tiene por objetivo principal la protección, conservación, recuperación y reintroducción del águila real en su área de distribución histórica en México a corto, mediano y largo plazos. Las estrategias principales se enfocan en:

• Difusión del valor ecológico, nacional e histórico de la especie.
• Elaboración de planes de conservación y manejo del águila real y su hábitat.
• Mantenimiento de poblaciones en cautiverio que sean viables genética y demográficamente.
• Apoyo a investigaciones enfocadas en la protección, conservación y recuperación de la especie.
• Elaboración y aplicación de programas regionales de inspección y vigilancia de las poblaciones.

Borrego cimarrón (Ovis canadensis)
El objetivo principal del programa es la conservación y recuperación de las poblaciones de manera compatible con el desarrollo social y económico del país a través de su aprovechamiento sustentable. Las estrategias se relacionan con:

• Conservación y protección del hábitat en México.
• Reintroducción de poblaciones en los estados de Coahuila, Chihuahua y Nuevo León.
• Aprovechamiento sustentable de la especie por las comunidades locales.
• Elaborar programas que permitan desarrollar técnicas y metodologías de manejo de las poblaciones y su hábitat.
• Promover proyectos de conservación en el marco del Suma (Sistema de Unidades de Manejo para la Conservación de la Vida Silvestre), así como proyectos y actividades de difusión, capacitación técnica y educación ambiental.

Berrendo (Antilocapra americana)
El objetivo principal del programa es la recuperación y conservación de las poblaciones del berrendo peninsular para removerlo de las listas de especies en peligro de extinción. Las estrategias del programa consisten en:

• Implementar medidas de conservación y protección del hábitat.
• Apoyo a programas de protección y vigilancia in situ.
• Llevar a cabo la reintroducción de poblaciones en áreas estratégicas.
• Realizar campañas de educación ambiental.
• Desarrollar programas de manejo y reproducción en cautiverio de la especie.

Oso negro (Ursus americanus)
El objetivo principal del programa es la recuperación y conservación de las poblaciones de oso negro y su hábitat en México. Las estrategias consisten en:

• Obtener información a partir de censos y monitoreos poblacionales para conocer con precisión las características actuales de las poblaciones, en lo que se refiere a su abundancia, distribución y estructura.
• Actualizar, evaluar y autorizar los planes de manejo en cada Unidad de Manejo para la Conservación de la Vida Silvestre (Uma) con miras a la conservación de la especie y de su hábitat.

Lobo gris mexicano (Canis lupus)
El objetivo final es lograr la reintroducción de grupos familiares de lobos mexicanos en varios bosques del país, que constituyan el núcleo de poblaciones silvestres viables y sanas para lograr la permanencia a largo plazo de la subespecie en territorio mexicano. Las estrategias fundamentales son:

• Continuar con los programas de reproducción en cautiverio para obtener un máximo número de individuos viables genéticamente.
• Búsqueda de sitios idóneos para la reintroducción de la especie.
• Restauración integral del hábitat.
• Establecimiento de un programa permanente de educación ambiental y aceptación social del papel de los depredadores en el medio silvestre.

Pinnípedos
Los pinnípedos mexicanos se encuentran representados por el lobo fino de Guadalupe, el elefante marino, el lobo marino de California y la foca de puerto. El objetivo del programa es la conservación de las poblaciones de estas especies por medio de acciones encaminadas a su conservación, recuperación y aprovechamiento sustentable. Las estrategias del programa consisten en:

• Evaluar el estado de las poblaciones en las aguas e islas adyacentes a los estados de Baja California, Baja California Sur, Sonora y Sinaloa.
• Localización de hábitat críticos y establecimiento de refugios, santuarios u otras áreas que permitan su protección y la de su entorno.
• Incrementar el número de ejemplares con programas cooperativos de manejo y reproducción bajo condiciones de cautiverio.
• Capacitación de recursos humanos, a nivel técnico y profesional, para el estudio, conservación y aprovechamiento sustentable de los pinnípedos en México en las áreas naturales protegidas y sus zonas de influencia.
• Elaborar y difundir programas educativos y de vigilancia participativa para todos los sectores relacionados con el recurso.

Cocodrilos
El objetivo del programa es la conservación y aprovechamiento sustentable de los cocodrilos y el caimán en México a través de la recuperación, investigación y manejo, que involucre a los distintos sectores de la sociedad. Las estrategias principales consisten en:

• Promover y desarrollar estudios relacionados con la distribución natural, hábitat y poblaciones de los cocodrilos y el caimán en las costas del Pacífico, Golfo y Caribe Mexicanos.
•Proponer refugios y santuarios como medidas de protección a las poblaciones silvestres amenazadas.
• Capacitación de recursos humanos a nivel técnico y profesional para la administración, conservación, manejo y uso sustentable en México.
• Difundir un amplio programa de educación ambiental dirigido a todos los sectores de la sociedad relacionados con las especies de cocodrilos y caimanes, involucrando a las comunidades en las estrategias y acciones.
• Proporcionar el respaldo y asesoría técnica a los programas regionales y locales de conservación, investigación, manejo y aprovechamiento sustentable de los cocodrilos y el caimán.
• Desarrollar y promover mercados para los ejemplares, productos y subproductos certificados y obtenidos de manera sustentable.

Tortugas marinas
El programa tiene por objetivo el llevar a cabo la recuperación de las poblaciones de tortugas marinas que ocurren en el país a una condición que permita removerlas de las listas de especies en peligro de extinción. Las estrategias consisten en:

• Regular y sistematizar las actividades de protección, conservación, investigación y manejo de las especies realizadas por todos los sectores involucrados en el territorio nacional.
• Establecer acciones de coordinación intra e interinstitucional en materia de conservación, protección, investigación y manejo.
• Coordinar acciones de colaboración con instituciones de educación y centros de investigación nacionales y extranjeros, así como con organizaciones no gubernamentales en materia de protección, conservación, investigación y manejo.
• Fortalecer las acciones de inspección y vigilancia en materia de tortugas marinas.
• Establecer proyectos de diversificación productiva en las zonas de influencia de los campamentos tortugueros.

Psitácidos
Los objetivos del proyecto se enfocan en la conservación y manejo en estado silvestre de las 11 especies determinadas como prioritarias, que son: loro cabeza amarilla (Amazona oratrix), guacamaya roja (Ara macao), guacamaya verde (Ara militaris), cotorra serrana occidental (Rhynchopsitta pachyrhyncha), cotorra serrana oriental (Rhynchopsitta terrisi), perico de Socorro (Aratinga brevipes), loro tamaulipeco (Amazona viridigenalis), loro corona azul (Amazona farinosa), loro cabeza oscura (Pionopsitta haematotis), loro corona lila (Amazona finschi) y loro nuca amarilla (Amazona auropalliata). Las estrategias principales consisten en:

• Difundir un programa de educación ambiental dirigido al conocimiento y protección de las especies de psitácidos.
• Capacitación de recursos humanos para la administración, conservación, manejo y uso sustentable en México.
• Llevar a cabo la cría en cautiverio de las diferentes especies con el fin de tener poblaciones viables genéticamente.
• Actualizar y promover la normatividad correspondiente con el comercio y tráfico de las especies.

Cícadas
El objetivo del programa es la conservación, recuperación, protección, manejo y aprovechamiento sustentable de las especies mexicanas de la familia Zamiaceae. Las principales estrategias consisten en:

• Definir medidas de protección para cada especie.
• Disminuir la presión extractiva de plantas y semillas del medio natural en razón del establecimiento, consolidación y fortalecimiento de Uma que manejen algunas de las especies en peligro de extinción.
• Incrementar el conocimiento científico de las zamiáceas mexicanas mediante estudios ecológicos y taxonómicos generales que permitan explorar el territorio nacional para aumentar la posibilidad de registro de nuevas especies.
• Determinar el estado actual de las poblaciones naturales de las especies y, con ello, establecer medidas de manejo para la conservación de cada especie en particular.
• Definir las técnicas, cantidades y sitios prioritarios para implementar programas de reintroducción de ejemplares cultivados en viveros.